توجد في مدينة قم معاهد ومجموعات بحثية تابعة لجامعة قم، والتي تعتبر ذراعًا للبحث العلمي للجامعة، والتي تشمل معهد البحوث البيئية، والفریق البحثی للملوثات البيئية، ومعهد أبحاث البيئة الخضراء، معهد الإدارة والقانون الاسلامی، والفریق البحثی لإدارة الموارد المائية، ومجموعة أبحاث الهياكل الخفيفة، ومجموعة البحث النسائية، ومجموعة العمل للحد من تأثير الغبار.
